Deciphering phagosome resolution using versatile particles

Organisation/Company

Institut Cochin - Équipe F. Niedergang : "Biologie des phagocytes, infection et immunité"

Research Field

Biological sciences » Biology
Biological sciences » Biological engineering
Chemistry

Researcher Profile

Recognised Researcher (R2)
Leading Researcher (R4)
First Stage Researcher (R1)
Established Researcher (R3)

Application Deadline

29 Apr 2026 - 22:00 (UTC)

Country

France

Type of Contract

Temporary

Job Status

Full-time

Offer Starting Date

1 Sep 2026

Is the job funded through the EU Research Framework Programme?

Not funded by a EU programme

Is the Job related to staff position within a Research Infrastructure?

No

Français : Les cellules mammifères doivent recycler les membranes et les nutriments après leur dégradation dans les lysosomes afin de maintenir l'homéostasie et de préserver les ressources. Cette activité de recyclage est particulièrement cruciale dans les cellules phagocytaires, où les particules phagocytées sont dégradées et réutilisées plutôt que rejetées. La phagocytose, processus d'internalisation et de digestion médiée par des récepteurs de particules de plus de 0,5 micron, conduit à la formation d'un phagosome qui mature au cours d'une série de fusions et de fissions avec les compartiments endosomaux pour former un phagolysosome. Cela implique un important remodelage du phagolysosome, avec des étapes de fragmentation et de fission, et les vésicules ainsi formées viennent ensuite reconstituer le pool de lysosomes, dans une étape appelée « résolution du phagosome ». Cependant, le mécanisme de résolution des phagolysosomes n'a pas encore été caractérisé en détail. Alors que le devenir des phagosomes et de leur contenu dépend des récepteurs de surface initialement activés, les mécanismes par lesquels les récepteurs phagocytaires modulent la résolution finale des phagosomes restent mal compris.

Nous étudierons ces étapes cruciales de la résolution phagosomale à l'aide de particules lipidiques de l'ordre du micron, fonctionnalisées avec des ligands phagocytaires et marquées par des traceurs fluorescents permettant de suivre le pH et l'activité protéolytique. Cette approche permettra une analyse innovante en temps réel des processus biochimiques.
English : 
 

Mammalian cells must recycle membranes and nutrients after degradation in lysosomes to maintain homeostasis and conserve resources. This recycling activity is particularly crucial in phagocytic cells, where engulfed material is degraded and reused rather than expelled. Phagocytosis, a receptor-mediated internalization and digestion of objects larger than 0.5 microns, leads to the formation of a phagosome that matures through a series of fusion and fission with the endosomal compartments to generate a phagolysosome. This implies important remodeling of the phagolysosome, with fragmentation and fission steps, and the resulting vesicles then replenish the pool of lysosomes, in a step called phagosome resolution. How phagolysosomes resolve however still lacks detailed characterization. While the fate of phagosomes and their internalized cargo depends on the surface receptors initially engaged, the mechanisms by which phagocytic receptors modulate phagosome terminal resolution remain poorly understood.

We will investigate these critical steps of phagosomal resolution using micron-sized lipid particles functionalized with phagocytic ligands and decorated with fluorescent tracers for pH and proteolytic activity. This design will enable innovative real-time analysis of biochemical and mechanical processes underlying phagosome maturation and resolution in living cells.

Funding category: Autre financement public
CNRS 80|Prime
PHD Country: France

Website

https://www.abg.asso.fr/fr/candidatOffres/show/id_offre/137547

Français : 

Le (la) candidat(e) devra être titulaire d’un master 2 en biologie ou immunologie, et avoir des compétences et/ou des intérêts dans les domaines suivants : biologie cellulaire, développement méthodologique, formulation, microscopie, interdisciplinarité.

Avoir de bonnes capacités de communication pour faire partie d'un projet multidisciplinaire collaboratif 

Travailler dans un laboratoire de confinement de niveau 2 (BLS 2) pour la manipulation de cellules sanguines humaines primaires (macrophages)

English : 

The candidate must hold a Master’s degree in biology or immunology and have skills and/or interests in the following areas: cell biology, methodological development, formulation, microscopy, and interdisciplinary work.

Possess strong communication skills to be part of a collaborative multidisciplinary project
Work in a Biosafety Level 2 (BSL-2) laboratory for the handling of primary human blood cells (macrophages)

Number of offers available

1

Company/Institute

Institut Cochin - Équipe F. Niedergang : "Biologie des phagocytes, infection et immunité"

Country

France

City

Paris

Geofield

Website

https://institutcochin.fr/equipes/biologie-phagocytes-infection-immunite

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